Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 LIFR-AS1-201ENST00000500733 3803 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 PALM2-201ENST00000314527 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 RASGEF1A-203ENST00000395809 4104 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 CAPN9-201ENST00000271971 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 TRAF3IP3-202ENST00000367024 2331 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 SCLT1-202ENST00000439369 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 SMAD3-204ENST00000540846 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 LINC00664-201ENST00000596203 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 AC005041.1-201ENST00000517883 7033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SCN2BO60939 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SCN2BO60939 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SCN2BO60939 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 AC127459.2-201ENST00000567395 932 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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