Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC4Q9Y696 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC4Q9Y696 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms