Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms