Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF18Q9Y5U5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms