Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms