Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO2Q9Y3B8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO2Q9Y3B8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms