Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF5Q9Y2D1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms