Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM35Q9UPQ4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms