Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAL4Q9UM19 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HPCAL4Q9UM19 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPCAL4Q9UM19 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPCAL4Q9UM19 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPCAL4Q9UM19 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPCAL4Q9UM19 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms