Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SARDHQ9UL12 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms