Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO4Q9UKT5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO4Q9UKT5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms