Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2D1Q9UJQ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2D1Q9UJQ7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2D1Q9UJQ7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2D1Q9UJQ7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2D1Q9UJQ7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2D1Q9UJQ7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2D1Q9UJQ7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2D1Q9UJQ7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2D1Q9UJQ7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms