Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIC8

LCMT1, Leucine carboxyl methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT1Q9UIC8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT1Q9UIC8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCMT1Q9UIC8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms