Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPN3Q9UHW5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPN3Q9UHW5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPN3Q9UHW5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPN3Q9UHW5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPN3Q9UHW5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPN3Q9UHW5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GPN3Q9UHW5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GPN3Q9UHW5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GPN3Q9UHW5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPN3Q9UHW5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms