Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ASIC3Q9UHC3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms