Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms