Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5BQ9UGL1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5BQ9UGL1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms