Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms