Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HACD3Q9P035 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms