Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP5Q9NZZ3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms