Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EHD3Q9NZN3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms