Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSD3Q9NYI0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms