Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK4Q9NYG8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms