Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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