Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms