Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms