Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUOX1Q9NRD9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms