Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FSCN3Q9NQT6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms