Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms