Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms