Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD33

MRPL47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL47Q9HD33 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPL47Q9HD33 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms