Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms