Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LY9Q9HBG7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms