Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms