Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCQ9H7C4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms