Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms