Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN2Q9H4D0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms