Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Q1

CDC42EP4, Cdc42 effector protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP4Q9H3Q1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP4Q9H3Q1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP4Q9H3Q1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP4Q9H3Q1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP4Q9H3Q1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP4Q9H3Q1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP4Q9H3Q1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP4Q9H3Q1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP4Q9H3Q1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP4Q9H3Q1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP4Q9H3Q1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms