Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX5Q9H2C1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms