Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB6CQ9H0N0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ9H0N0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms