Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms