Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms