Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLVAPQ9BX97 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLVAPQ9BX97 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLVAPQ9BX97 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PLVAPQ9BX97 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLVAPQ9BX97 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLVAPQ9BX97 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLVAPQ9BX97 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLVAPQ9BX97 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms