Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDCA7Q9BWT1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA7Q9BWT1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDCA7Q9BWT1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDCA7Q9BWT1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CDCA7Q9BWT1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA7Q9BWT1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA7Q9BWT1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA7Q9BWT1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA7Q9BWT1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA7Q9BWT1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA7Q9BWT1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA7Q9BWT1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA7Q9BWT1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms