Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms