Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERC2P3Q9BVR0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms