Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms