Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDC1Q9BTX1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms