Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
THUMPD2Q9BTF0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms