Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00467Q9BRT7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00467Q9BRT7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms